MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 59504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013921	CAA	2	6	6	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013921	ATT	2	6	45	50	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013921	TTA	2	6	80	85	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013921	TAAA	2	8	108	115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013921	AAC	2	6	132	137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013921	GTT	2	6	148	153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013921	GTT	2	6	171	176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013921	T	7	7	228	234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013921	T	8	8	240	247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013921	CAA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013921	TA	3	6	287	292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013921	A	6	6	307	312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013921	ATTAA	2	10	321	330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013921	TTA	2	6	333	338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013921	AATTA	2	10	341	350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013921	ATA	2	6	356	361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013921	TAT	2	6	362	367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013921	AGG	2	6	411	416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013921	ATC	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577266
20	NC_013921	CCA	2	6	488	493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289577266
21	NC_013921	A	6	6	576	581	100 %	0 %	0 %	0 %	289577266
22	NC_013921	TAA	2	6	584	589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577266
23	NC_013921	AT	3	6	597	602	50 %	50 %	0 %	0 %	289577266
24	NC_013921	ATT	2	6	607	612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577266
25	NC_013921	ATG	2	6	614	619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577266
26	NC_013921	AGA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
27	NC_013921	GAA	3	9	673	681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
28	NC_013921	ACT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577266
29	NC_013921	TGT	2	6	774	779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577266
30	NC_013921	TTTA	2	8	852	859	25 %	75 %	0 %	0 %	289577266
31	NC_013921	GGA	2	6	865	870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289577266
32	NC_013921	ATGC	2	8	895	902	25 %	25 %	25 %	25 %	289577266
33	NC_013921	TAA	2	6	918	923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577266
34	NC_013921	AAT	2	6	942	947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577266
35	NC_013921	GAC	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577266
36	NC_013921	GAA	2	6	1009	1014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
37	NC_013921	GAT	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577266
38	NC_013921	A	6	6	1075	1080	100 %	0 %	0 %	0 %	289577266
39	NC_013921	GAAC	2	8	1081	1088	50 %	0 %	25 %	25 %	289577266
40	NC_013921	AAG	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
41	NC_013921	T	6	6	1099	1104	0 %	100 %	0 %	0 %	289577266
42	NC_013921	CAAA	3	12	1130	1141	75 %	0 %	0 %	25 %	289577266
43	NC_013921	CCA	2	6	1237	1242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289577266
44	NC_013921	A	6	6	1273	1278	100 %	0 %	0 %	0 %	289577266
45	NC_013921	CGA	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577266
46	NC_013921	A	6	6	1331	1336	100 %	0 %	0 %	0 %	289577266
47	NC_013921	TCAA	2	8	1338	1345	50 %	25 %	0 %	25 %	289577266
48	NC_013921	TAA	2	6	1370	1375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577266
49	NC_013921	TAA	2	6	1455	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577266
50	NC_013921	AAG	3	9	1490	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
51	NC_013921	TAT	2	6	1507	1512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577266
52	NC_013921	AGA	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
53	NC_013921	A	6	6	1551	1556	100 %	0 %	0 %	0 %	289577266
54	NC_013921	AG	3	6	1594	1599	50 %	0 %	50 %	0 %	289577266
55	NC_013921	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
56	NC_013921	A	6	6	1673	1678	100 %	0 %	0 %	0 %	289577266
57	NC_013921	AGA	2	6	1695	1700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
58	NC_013921	CTT	2	6	1705	1710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577266
59	NC_013921	GAA	2	6	1723	1728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
60	NC_013921	A	6	6	1731	1736	100 %	0 %	0 %	0 %	289577266
61	NC_013921	TTA	2	6	1749	1754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577266
62	NC_013921	T	6	6	1794	1799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013921	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013921	CAA	2	6	1846	1851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013921	CTTT	2	8	1865	1872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013921	TAT	2	6	1907	1912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013921	ACT	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013921	TTATT	2	10	1930	1939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013921	TAT	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013921	A	7	7	1958	1964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013921	A	7	7	1985	1991	100 %	0 %	0 %	0 %	289577267
72	NC_013921	TG	4	8	1999	2006	0 %	50 %	50 %	0 %	289577267
73	NC_013921	ATT	2	6	2017	2022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577267
74	NC_013921	G	6	6	2046	2051	0 %	0 %	100 %	0 %	289577267
75	NC_013921	TCC	2	6	2054	2059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289577267
76	NC_013921	TAC	2	6	2062	2067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577267
77	NC_013921	AGA	3	9	2173	2181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577267
78	NC_013921	TAG	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577267
79	NC_013921	TAA	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577267
80	NC_013921	A	6	6	2404	2409	100 %	0 %	0 %	0 %	289577267
81	NC_013921	T	6	6	2549	2554	0 %	100 %	0 %	0 %	289577267
82	NC_013921	GAA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577267
83	NC_013921	AT	3	6	2609	2614	50 %	50 %	0 %	0 %	289577267
84	NC_013921	AGA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577267
85	NC_013921	AT	3	6	2646	2651	50 %	50 %	0 %	0 %	289577267
86	NC_013921	GAAG	2	8	2714	2721	50 %	0 %	50 %	0 %	289577267
87	NC_013921	AAT	2	6	2834	2839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577267
88	NC_013921	TTA	2	6	2868	2873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577267
89	NC_013921	GAA	3	9	2996	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577267
90	NC_013921	TAA	3	9	3039	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577267
91	NC_013921	T	6	6	3117	3122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013921	AT	3	6	3150	3155	50 %	50 %	0 %	0 %	289577268
93	NC_013921	AT	3	6	3177	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	289577268
94	NC_013921	AAGCA	2	10	3206	3215	60 %	0 %	20 %	20 %	289577268
95	NC_013921	ATTT	2	8	3216	3223	25 %	75 %	0 %	0 %	289577268
96	NC_013921	AAAAGT	2	12	3231	3242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577268
97	NC_013921	A	6	6	3271	3276	100 %	0 %	0 %	0 %	289577268
98	NC_013921	AGAAT	2	10	3392	3401	60 %	20 %	20 %	0 %	289577269
99	NC_013921	AATA	2	8	3412	3419	75 %	25 %	0 %	0 %	289577269
100	NC_013921	TTA	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
101	NC_013921	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
102	NC_013921	AAT	2	6	3556	3561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577269
103	NC_013921	A	7	7	3581	3587	100 %	0 %	0 %	0 %	289577269
104	NC_013921	A	6	6	3602	3607	100 %	0 %	0 %	0 %	289577269
105	NC_013921	TAA	2	6	3613	3618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577269
106	NC_013921	TTA	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
107	NC_013921	AATAA	2	10	3638	3647	80 %	20 %	0 %	0 %	289577269
108	NC_013921	T	6	6	3687	3692	0 %	100 %	0 %	0 %	289577269
109	NC_013921	ATA	2	6	3710	3715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577269
110	NC_013921	AAG	2	6	3717	3722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577269
111	NC_013921	TAT	2	6	3763	3768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
112	NC_013921	A	6	6	3835	3840	100 %	0 %	0 %	0 %	289577269
113	NC_013921	AAG	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577269
114	NC_013921	AT	3	6	3864	3869	50 %	50 %	0 %	0 %	289577269
115	NC_013921	TAG	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577269
116	NC_013921	AAT	2	6	3910	3915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577269
117	NC_013921	ATT	2	6	3930	3935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
118	NC_013921	A	6	6	3937	3942	100 %	0 %	0 %	0 %	289577269
119	NC_013921	A	7	7	3958	3964	100 %	0 %	0 %	0 %	289577269
120	NC_013921	A	8	8	4051	4058	100 %	0 %	0 %	0 %	289577269
121	NC_013921	GAAA	2	8	4063	4070	75 %	0 %	25 %	0 %	289577269
122	NC_013921	ACA	2	6	4109	4114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289577269
123	NC_013921	ATT	2	6	4145	4150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
124	NC_013921	TTC	2	6	4177	4182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577269
125	NC_013921	A	6	6	4240	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	289577269
126	NC_013921	GAT	2	6	4277	4282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577269
127	NC_013921	A	6	6	4309	4314	100 %	0 %	0 %	0 %	289577269
128	NC_013921	TAC	2	6	4360	4365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577269
129	NC_013921	GTT	2	6	4412	4417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577269
130	NC_013921	A	6	6	4436	4441	100 %	0 %	0 %	0 %	289577270
131	NC_013921	GGC	2	6	4456	4461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289577270
132	NC_013921	TGT	2	6	4509	4514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577270
133	NC_013921	ACT	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577270
134	NC_013921	GAA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577270
135	NC_013921	TTAT	3	12	4634	4645	25 %	75 %	0 %	0 %	289577270
136	NC_013921	A	6	6	4682	4687	100 %	0 %	0 %	0 %	289577270
137	NC_013921	ATT	2	6	4732	4737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577271
138	NC_013921	A	6	6	4748	4753	100 %	0 %	0 %	0 %	289577271
139	NC_013921	ATT	2	6	4786	4791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577271
140	NC_013921	AGA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
141	NC_013921	A	6	6	4817	4822	100 %	0 %	0 %	0 %	289577271
142	NC_013921	AGAA	2	8	4842	4849	75 %	0 %	25 %	0 %	289577271
143	NC_013921	AGA	2	6	4881	4886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
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178	NC_013921	CTTA	2	8	6344	6351	25 %	50 %	0 %	25 %	289577271
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200	NC_013921	TAC	2	6	7319	7324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577272
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222	NC_013921	T	6	6	8120	8125	0 %	100 %	0 %	0 %	289577273
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254	NC_013921	CAT	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_013921	A	6	6	9215	9220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_013921	TATAT	2	10	9258	9267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_013921	TAT	3	9	9287	9295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_013921	TAA	3	9	9304	9312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_013921	T	6	6	10010	10015	0 %	100 %	0 %	0 %	289577274
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